В 1893 г. А.А. Иностранцев возглавил Геологическую часть Кабинета Его Императорского Величества. Летом 1894 -1896 г. осуществлял экспедиционные геологические работы на С. Алтае. Съёмочные работы на Алтае в целом проводились по 1915 г. Обработка результатов этих и последующих работ на Алтае не была завершена, обсуждалась после 1917 г. с Горным Департаментом. После его переезда в г. Москву вышла из-под контроля и не финансировалась.
Сам А.А. Иностранцев так вкратце описывает работу на Алтае в своих «Воспоминаниях». «Положением весь Алтайский округ был разделен на квадраты, имеющие в длину 75 верст и в ширину 90 верст, т. е. 6750 кв. верст, для исследования которых полагалось одно лето. Исключением из этого, с одной стороны, были местности, представляющиеся однооб-разными в своем геологическом строении, и такие местности геологами иногда захватываются по два и даже по три квадрата. С другой стороны, горные местности, сравнительно малонаселенные и лишенные дорог, часто не представляли физической возможности произвести на одном квадрате геологические исследования, а потому допускалось исследование такого пространства иногда и за два года. По составлении программы в первую очередь должна была быть исследована местность, где лежит довольно известный Кузнецкий бассейн, содержащий богатые залежи каменного угля, границы распространения которого не были определены; затем предполагалось исследование наиболее заселенных равнинных местностей, а уже за ними остальных областей и рудных месторождений.