С 1938 по 1941 год Андрей Дмитриевич был аспирантом у профессора П.А. Православлева.
В 1939-1940 гг. работал в Средней Азии по сбору материалов для диссертации. В этой связи принял участие в геологических работах Киргизского Геологического Управления в южной и восточной Фергане. С этого времени он и приступил к изучению верхнепалеозойских толщ Средней Азии, чем занимался в дальнейшем всю свою жизнь, став авторитетным специалистом в области стратиграфии и палеонтологии.
Далее – началась война.
В июле 1941 г. А. Д. был мобилизован для строительства оборонительных рубежей в Ленинградской и Калининской областях. С 1942 по 1945 гг. – воевал на Западном, Калининском, 1-м прибалтийском, 1-м и 3-м Белорусских фронтах. Пережил тиф, ранения, контузии.
За боевые заслуги на фронтах Отечественной войны был награжден орденом "Красная Звезда", медалями "За отвагу", двумя медалями "За боевые заслуги", "за взятие Кенигсберга" и др. Как участник боев при разгроме нескольких немецких группировок получил несколько благодарностей от Верховного Главнокомандующего. Кроме того, был награжден значком «Отличный разведчик».