Продукты жизнедеятельности бактерий и цианобионтов относят к хемофоссилиям. Бактерии принимают участие в образовании железистых, марганцевых и фосфоритовых конкреций, графитов, серы, нефти, газа и т. д. От жизнедеятельности цианобионтов сохраняются известковые образования различной формы: слоистые (прикрепленные к субстрату) – строматолиты, округлые (желваки, не прикрепленные к субстрату) – онколиты и комковидные образования неправильных очертаний – катаграфии.