Окремнённые органические остатки обычно встречаются в центре кремневых стяжений и конкреций. В континентальных условиях кремнезём (например, в виде опала) может пропитывать отмершие стволы деревьев, погребенных под вулканическими пеплами, богатыми кремнекислотой.