Растения при фоссилизации обычно разрушаются полностью вследствие процессов гниения и брожения. Если же они сохраняются, то, как правило, в виде торфа или обугленных остатков различных их частей (стволов, шишек и пр.), которые могут преобразоваться позже в бурый или каменный уголь. Однако при фоссилизации (петрификации) растительные ткани могут замещаться различными минеральными соединениями, чаще всего кремнеземом, карбонатами, пиритом и лимонитом. Так, известны крупные скопления замещенных кремнеземом стволов деревьев («окаменелые леса»).