Отцом выдающегося палеонтолога был Эраст Петрович Янишевский (1829 -1906) - дворянин, ученик Н.И. Лобачевского, профессор чистой математики Казанского университета (1865), городской голова г. Казани (1871—1881), должность которого исполнял, сохранив при этом должность университетского профессора. При нем в Казани был устроен водопровод, газовое освещение, конно-железная дорога, замощен ряд улиц и площадей. В дальнейшем он служил в Государственном контроле и был управляющим контрольными палатами в Перми и Казани, и закончил службу в чине действительного статского советника. Его жена – Мария Петровна – была домохозяйкой.
В Казани Э.П. Янишевскому принадлежал небольшой деревянный одноэтажный дом, в котором жила его большая семья. В ней было девять детей – пять мальчиков и четыре девочки.