В течение десятилетнего пребывания в Томске М.Э. Янишевский выполнил ряд крупных геологических и палеонтологических работ. В 1910 году М.Э. Янишевский защитил докторскую диссертацию «Нижне-каменноугольный известняк около поселка Хабарное Орского уезда, Оренбургской губернии» в Казанском университете. В том же году в Томске им была опубликована одноименная научная монография.